応募者に健康診断書を提出させることについては、慎重を期す必要がある。

採用選考時の健康診断については、「採用選考時に健康診断を実施することは、応募者の適性と能力の判断に必要のない事項を把握する可能性があり、結果として、就職差別につながる恐れがある。健康診断を実施する場合には、応募者の適性と能力を判断するうえで健康診断が真に必要かどうか慎重に検討する必要がある」という旨の行政通達が出されている。

したがって、入社を希望する者の従事する業務などを考慮して、必要性がなければ省略することが望ましい。

なお、労働安全衛生規則第43条は、常時使用する従業員を雇い入れる際は、医師による健康診断を行なわなければならない旨を規定しているが、これは採用選考時の健康診断を義務づけたものではなく、採用決定後の適正配置等のための健康診断について定めたものであることに注意が必要である。